茶樹(shù)為多年生異花授粉植物，具有高度異質(zhì)性和雜合性。中國西南地區是茶樹(shù)的起源地，茶樹(shù)從起源地向中國其他地區和國外的自然傳播和人為傳播過(guò)程中，積累了自然演化和人工選擇的變異，從而在各茶區形成了豐富的茶樹(shù)品種資源。
然而在茶樹(shù)品種資源的大量引種及頻繁的品種資源交換過(guò)程中，造成同名異物、同物異名的現象，不僅給茶樹(shù)品種資源保護利用帶來(lái)諸多困難，也損害了消費者的權益。因而科學(xué)準確地區分和鑒定茶樹(shù)品種資源具有重要意義。
本研究通過(guò)收集國內外103份茶樹(shù)種質(zhì)，利用SNP標記并結合茶樹(shù)品種資源基本信息構建茶樹(shù)品種資源分子身份證，以期為茶樹(shù)品種資源保護鑒定提供一種新思路。
1供試材料
供試茶樹(shù)品種資源來(lái)源于武夷學(xué)院茶樹(shù)種質(zhì)資源圃(福建省武夷山市)和福建省農業(yè)科學(xué)院茶葉研究所茶樹(shù)種質(zhì)資源圃(福建省福安市)，其中，中國茶樹(shù)品種資源有101份，來(lái)自華南、西南、江南、江北四大茶產(chǎn)區的10個(gè)茶葉主產(chǎn)區省份;國外茶樹(shù)品種2份，包括日本的玉綠和格魯吉亞的格魯吉亞1號。
2結果
1、標記獲得與分析
從茶樹(shù)的表達序列標簽數據庫中挖掘出1786個(gè)候選SNP位點(diǎn)。根據序列保守性，篩選出96個(gè)SNP標記位點(diǎn)，與最新茶樹(shù)基因組比對發(fā)現候選位點(diǎn)較均勻地分布于茶樹(shù)全基因組的15條染色體上;對茶樹(shù)品種資源的候選SNP位點(diǎn)的多態(tài)性信息進(jìn)行分析，剔除10個(gè)不具多態(tài)性的位點(diǎn)，剩余86個(gè)位點(diǎn)的信息指數平均值為0.517，觀(guān)測雜合度平均值為0.370，期望雜合度平均值為0.346，固定指數平均值為-0.036，次等位基因頻率平均值為0.269。從86個(gè)SNP位點(diǎn)中篩選出24個(gè)多態(tài)性高的SNP位點(diǎn)，組成DNA指紋圖譜，可區分出全部參試茶樹(shù)品種資源。
對24個(gè)SNP位點(diǎn)組成的DNA指紋圖譜并結合茶樹(shù)品種資源基本信息進(jìn)行數字編碼，最終形成由28位數字組成的茶樹(shù)品種資源分子身份證。
2、茶樹(shù)品種資源信息編碼
茶樹(shù)的基本信息由4位數字組成，其中，茶樹(shù)品種資源類(lèi)型分類(lèi)參考陳亮等方法。第1位數字代表茶組植物具體物種，茶樹(shù)(Camellia sinensis (L.) O.Kuntze)為1，大廠(chǎng)茶(C. tachangensis F. C. Zhang)為2，厚軸茶(C. crassicolumna Chang)為3，大理茶(C. taliensis (W. W. Smith) Melchior)為4，禿房茶(C. gymnogyna Chang)為5;第2-3位數字代表行政區劃代碼，如福建為35，浙江為33，云南為53，國外為00;第4位數字代表茶樹(shù)品種資源類(lèi)型，野生茶樹(shù)為1，地方品種和地方種質(zhì)為2，優(yōu)良品種(含育成品種)為3，新選品系、株系為4，國外品種為5。后24位數字由24個(gè)SNP分子標記的基因型轉化而來(lái)。
以福鼎大白茶舉例：
屬茶組植物中的茶樹(shù)(C. sinensis)，原產(chǎn)于福建，品種資源類(lèi)型為優(yōu)良品種，轉換成數字碼為1353;其24個(gè)SNP分子標記的基因型分別為T(mén)C、TT、AT、CT、GG、GG、CC、TC、TG、TC、TT、AG、GG、TT、CC、AG、CT、TT、CC、AT、GG、GG、CC、TC，轉換成24位數字碼為131132311121332112313231。則福鼎大白茶的分子身份證為1353131132311121332112313231。
3結論與意義
依據SNP標記的多態(tài)性信息，篩選SNP位點(diǎn)，精準區分全部供試茶樹(shù)品種，并將24個(gè)SNP位點(diǎn)所構建的茶樹(shù)品種資源DNA指紋圖譜及品種資源的基本屬性信息編碼成特定的數字串，使每份茶樹(shù)品種資源具有唯一的分子身份證，并生成相應的條形碼和二維碼，可快速被掃碼設備識別。
本研究結果對于茶樹(shù)品種資源區分和精準鑒定、分子數據數字化建立具有重要的意義和實(shí)際應用價(jià)值，為茶樹(shù)品種資源DNA分子身份證的構建提供了思路。
來(lái)源：茶科學(xué)
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